鬼峰主要是由交叉污染造成的。如鬼峰的峰寬L．j樣品峰的類似(具有類似的保留時間)，則污染物可能是與樣品同時進入色譜柱的。如果鬼峰的峰寬比樣品峰寬很多，則污染物極可能在進樣品前已存在于色譜柱中。它們會在下次分析時洗脫，并且通常峰很寬。有時，多個鬼峰來自于多次進樣疊加，因此，洗脫時呈現圓丘峰或圓包峰，常常隨基線的漂移或偏離而出現，提高溫度程序最終溫度或延長時間是減少或消除鬼峰問題的方法之一。另外，在每次進樣后或在一系列進樣后進行短暫的烘烤，也可以從色譜柱中去除保留性較強的化合物，從而避免導致鬼峰的出現。

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